Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL23Q8NBE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL23Q8NBE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms