Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms