Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVOPQ8N4V2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms