Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VWDEQ8N2E2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
VWDEQ8N2E2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VWDEQ8N2E2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms