Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT20Q8IY31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT20Q8IY31 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT20Q8IY31 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms