Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC6Q8IVU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC6Q8IVU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms