Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA4Q8IV77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms