Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2BQ7L1I2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2BQ7L1I2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms