Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA6Q6ZSJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHISA6Q6ZSJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms