Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf50Q6ZRC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf50Q6ZRC1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms