Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC36A4Q6YBV0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms