Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LBX2Q6XYB7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LBX2Q6XYB7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms