Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms