Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA2Q6UW10 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA2Q6UW10 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms