Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms