Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP4R4Q6NUP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms