Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF6Q6KF10 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms