Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC102BQ68D86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms