Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USPL1Q5W0Q7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms