Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GARNL3Q5VVW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms