Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF20Q5VTR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF20Q5VTR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF20Q5VTR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF20Q5VTR2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF20Q5VTR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF20Q5VTR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms