Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP9Q5VTM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP9Q5VTM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms