Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR78Q5VTH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR78Q5VTH9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms