Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOGA3Q5TF21 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOGA3Q5TF21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms