Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LGSNQ5TDP6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGSNQ5TDP6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms