Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN11Q5T124 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN11Q5T124 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms