Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSL3PQ5NE16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSL3PQ5NE16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms