Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms