Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF628Q5EBL2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF628Q5EBL2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms