Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms