Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL12Q53G59 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms