Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC1Q4ZHG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms