Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GREB1Q4ZG55 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms