Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms