Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTU2Q2VPK5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTU2Q2VPK5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms