Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FHOD3Q2V2M9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms