Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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