Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP1Q16831 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP1Q16831 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms