Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B3Q16720 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B3Q16720 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B3Q16720 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
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