Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFE2Q16621 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms