Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP2Q16527 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP2Q16527 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP2Q16527 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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