Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MSMO1Q15800 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MSMO1Q15800 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms