Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATXN8Q156A1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATXN8Q156A1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms