Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B3Q15393 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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