Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF4Q15306 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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