Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKX1-1Q15270 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NKX1-1Q15270 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms