Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD1Q15011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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