Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPHQ15003 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPHQ15003 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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