Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1I3Q14994 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1I3Q14994 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1I3Q14994 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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