Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SQLEQ14534 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SQLEQ14534 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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